问题：2003年A公司工会代理职工为B房地产商签订了集体购房合同，标的1.2亿元（占地37亩的独立小区）。2008年职工（460户）分别与B房地产公司签订了商品房买卖合同，在这个小区内有2万平米地下车位，A公司于2008年初与B房地产商签订了购买5千平米地下车位的合同。在剩下的1.5万平米的地下车位协商购买中，A公司发现地下车位雨季积水，有重大质量隐患，B公司声称小区旁的道路施工排水系统不畅，待道路施工完毕后就不会有积水了，A公司提出暂留500万元作为保质金，待2007年雨季（此道路已施工完毕)过后，地下车位不积水就支付剩余的500万元，B公司不接受，提出解除合同（所有合同），包括与职工签订的商品房买卖合同。请问：A公司怎么处理好？
解答：问题出在A公司欲保留的500万元保质金太高，且地下车库积水具有不确定性，不是B房地产商施工质量问题所造成的，按说B公司不接受是有一定道理的。
首先，房产作为购买的主要商品没有产品质量问题应视为B公司履行了主要的合同义务，A公司应当如约付款。少付款只能是构成对B公司的权益损害。
其次，如果地下车库排水不畅，双方可以约定由B公司进行维修，也可以适当保留一部分质保金单独存放，直到地下排水通畅不会影响到地下车位正常使用为止，释放保留的质保金。对此，应当明确，保留的保质金不能作为B公司违约的违约金处罚，因数额过大，反而会影响B公司此后合同义务的履行。
第三，B公司以A公司欲保留质保金为由，提出解除合同不妥。购房合同应当依约全面履行，只有车库购买合同中存在争议，双方只解决车库争议即可，不应牵涉到无争议的购房合同。所以，公司应在履行购房合同基础上，对地下车库积水情况与B公司进行谈判，却不应对能履行和履行无异议部分全面推翻。A公司应当在确保职工购房合法权益基础上，督促B公司履行剩余义务，对地下车库积水、排水进行检查，保证地下车库安全使用。